Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GSCP56915 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GSCP56915 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms