Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTBP2P56545 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms