Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
POLR2KP53803 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms