Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IDH3AP50213 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms