Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF6P49848 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF6P49848 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms