Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLK1P49759 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLK1P49759 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms