Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCT3P49368 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCT3P49368 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCT3P49368 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms