Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRPC1P48995 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms