Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PTPN7P35236 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms