Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFNP31947 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFNP31947 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFNP31947 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFNP31947 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFNP31947 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFNP31947 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFNP31947 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFNP31947 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFNP31947 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFNP31947 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFNP31947 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFNP31947 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFNP31947 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFNP31947 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFNP31947 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SFNP31947 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SFNP31947 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFNP31947 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SFNP31947 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFNP31947 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFNP31947 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFNP31947 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFNP31947 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFNP31947 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFNP31947 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFNP31947 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFNP31947 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFNP31947 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFNP31947 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFNP31947 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFNP31947 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFNP31947 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFNP31947 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms