Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HLA-DMAP28067 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
HLA-DMAP28067 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms