Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP11P24347 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MMP11P24347 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MMP11P24347 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MMP11P24347 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MMP11P24347 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MMP11P24347 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MMP11P24347 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MMP11P24347 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MMP11P24347 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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