Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMNB1P20700 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMNB1P20700 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms