Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms