Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNAP12004 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PCNAP12004 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNAP12004 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNAP12004 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNAP12004 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNAP12004 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNAP12004 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNAP12004 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNAP12004 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNAP12004 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNAP12004 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNAP12004 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNAP12004 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNAP12004 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNAP12004 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNAP12004 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNAP12004 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNAP12004 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNAP12004 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNAP12004 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNAP12004 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNAP12004 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNAP12004 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNAP12004 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNAP12004 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNAP12004 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PCNAP12004 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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