Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOA4P06727 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOA4P06727 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA4P06727 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA4P06727 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA4P06727 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA4P06727 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA4P06727 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA4P06727 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA4P06727 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA4P06727 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA4P06727 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA4P06727 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA4P06727 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA4P06727 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA4P06727 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA4P06727 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA4P06727 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA4P06727 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA4P06727 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA4P06727 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA4P06727 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA4P06727 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA4P06727 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA4P06727 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA4P06727 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA4P06727 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA4P06727 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOA4P06727 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms