Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 AC106788.1-201ENST00000550753 2661 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 ATP13A2-201ENST00000326735 3840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 SLC44A4-203ENST00000375562 2505 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 SNHG20-202ENST00000434411 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 PPARD-205ENST00000448077 3516 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CCDC179H3BU77 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms