Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms