Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM4A7MD48 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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