Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC169A6NNP5 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC169A6NNP5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms