Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms