Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms