Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DTX4Q9Y2E6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DTX4Q9Y2E6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms