Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC12A4Q9UP95 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms