Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms