Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms