Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IFNKQ9P0W0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms