Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0T7

TMEM9, Transmembrane protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9Q9P0T7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM9Q9P0T7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms