Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PSD3Q9NYI0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms