Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GIN1Q9NXP7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms