Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THUMPD1Q9NXG2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms