Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM248Q9NWD8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM248Q9NWD8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM248Q9NWD8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM248Q9NWD8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM248Q9NWD8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM248Q9NWD8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM248Q9NWD8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM248Q9NWD8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM248Q9NWD8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM248Q9NWD8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM248Q9NWD8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM248Q9NWD8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM248Q9NWD8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM248Q9NWD8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM248Q9NWD8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM248Q9NWD8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM248Q9NWD8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms