Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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FANCFQ9NPI8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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