Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLMQ9NP87 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLMQ9NP87 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLMQ9NP87 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLMQ9NP87 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLMQ9NP87 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLMQ9NP87 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLMQ9NP87 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLMQ9NP87 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLMQ9NP87 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLMQ9NP87 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLMQ9NP87 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLMQ9NP87 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLMQ9NP87 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLMQ9NP87 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLMQ9NP87 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLMQ9NP87 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLMQ9NP87 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLMQ9NP87 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLMQ9NP87 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLMQ9NP87 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POLMQ9NP87 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms