Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB18Q9NP72 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms