Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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