Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 OSTCP1-202ENST00000522287 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAF1Q9H7N4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms