Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
C11orf49Q9H6J7 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.2 ms