Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BHLHE41Q9C0J9 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms