Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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FOXQ1Q9C009 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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FOXQ1Q9C009 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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FOXQ1Q9C009 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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FOXQ1Q9C009 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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