Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM54Q9BYV2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms