Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NIFKQ9BYG3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms