Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLDIP3Q9BY77 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms