Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms