Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIRIP3Q9BW71 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HIRIP3Q9BW71 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms