Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP58Q9BVL2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms