Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PMCHL2Q9BQD1 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms