Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SPOCK3Q9BQ16 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SPOCK3Q9BQ16 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms