Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SORT1Q99523 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms