Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SIN3AQ96ST3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SIN3AQ96ST3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms